O Ensino Fundamental II, do 6º ao 9º Ano, desenvolve seu trabalho tendo como base as características da Educação Jesuíta e o Paradigma Pedagógico Inaciano. O professor atua como mediador entre o conhecimento e o aluno e este participa envolvendo-se como sujeito ativo na construção da aprendizagem. A partir da contextualização do conteúdo e das atividades realizadas, as disciplinas tornam-se cada vez mais significativas, motivando os alunos à pesquisa, à descoberta, ao uso da criatividade, chegando à reflexão e à concretização de sua aprendizagem.